Do júna 2014 pôsobilo v operácii ISAF jedenásť príslušníkov vojenskej dopravy v rámci NSE pôsobiaceho na vojenskej leteckej základni v Kandaháre.  

Hlavnou úlohou bola príprava, koordinácia a zabezpečenie strategických a taktických leteckých prepráv tzv. ITAS (Intra Theatre Airlift System) prostredníctvom zmluvného prepravcu Ministerstva obrany SR a prostredníctvom koaličných partnerov.

Slovenská republika pôsobila na území Afganistanu od roku 2001 najprv v operácii koaličných síl Trvalá Sloboda („ENDURING FREEDOM“) a následne v operácii ISAF („International Security Assistance Force“).

Spôsobilosti jednotiek OS SR (ako aj ich dislokácia v rámci Afganistanu) sa v priebehu rokov menili, pričom v roku 2012 bolo rozhodnuté o stiahnutí multifunkčnej ženijnej jednotky (táto bola v roku 2001 prvou jednotkou OS SR vyslanou do operácie Trvalá Sloboda).

Vzhľadom na bezpečnostné riziká a nestabilitu v regióne bolo realizované stiahnutie techniky ženijnej jednotky a časti v operácii neupotrebiteľných kontajnerov a materiálu výhradne letecky a to prostredníctvom:

• projektu SALIS,
• zmluvného prepravcu MO SR,
• strategického partnera v rámci „Lift And Sustain Coalition Partners“.

V rotácii JÚN 2014 – vzhľadom na plánované úplné stiahnutie z operácie ISAF boli v rámci jednej rotácie vyslaní dvaja príslušníci vojenskej dopravy na zabezpečenie prípravy, koordinácie a vlastnej realizácie stiahnutia z tejto náročnej vojenskej operácie.

Stiahnutie z operácie ISAF prebehlo v mesiaci september 2014 a na leteckej základni v Kandaháre zostali len príslušníci NSE a likvidačná skupina. Ich úlohou bolo úplne zrušiť slovenský kemp, odovzdať priestory veleniu základne a presunúť sa do nových priestorov na leteckej základni v Kábule, kde Slovensko už v obmedzenom počte pokračovalo v operácii Resolute Support. Úplne poslední Slováci, ktorí opúšťali leteckú základňu v Kandaháre dňa 7.11.2014, boli príslušníci vojenskej dopravy.

Dňa 19.12.2014 odleteli z Kábulu poslední príslušníci ISAF a Slovensko začalo svoje pôsobenie v operácii Resolute Support, už ale bez stále prítomného príslušníka vojenskej dopravy. Príslušník vojenskej dopravy zostal ako člen riadiacej skupiny v rámci každej rotácie slovenského kontingentu.