Po prijatí zákona o zániku ČSFR a vytvorení národných republík, Slovenskej a Českej, bolo prijaté politické rozhodnutie o vytvorení Armády Slovenskej republiky. Bolo rozhodnuté, že súčasťou jej budovania bude aj výsadkový útvar špeciálneho určenia, svojím predurčením začlenený do systému spravodajského zabezpečenia a obrany Slovenskej republiky.

• od 2. novembra do 11. decembra 1992 absolvovala skupina dôstojníkov a práporčíkov z 13. a 14. prieskumného práporu špeciálny precvičovací kurz v 6. špeciálnej skupine
  
  
• v dňoch 17. a 18. novembra 1992 bol, už za účasti budúceho veliteľa 3. špeciálneho odriadu plukovníka Jozefa Tučeka, vykonaný kombinovaný presun po železnici a vlastnej osi do posádky Žilina
  
  
• 1. januára 1993 vnikla samostatná Slovenská republika, s ktorou bola vytvorená i Armáda Slovenskej republiky
  
  
• 4. januára 1993, na základe rozkazu veliteľa ASR, prevzal velenie nad novovytvoreným 3. špeciálnym odriadom plukovník Jozef Tuček
  
  
• 29. januára 1993 vykonali príslušníci 3. špeciálneho odriadu prvú slávnostnú vojenskú prísahu, čím na seba prevzali svoj diel zodpovednosti za obranu Slovenskej republiky
  
  
• 1. mája 1993 bol rozhodnutím veliteľa Armády Slovenskej republiky 3. špeciálny odriad začlenený do systému bojovej pohotovosti
  
  
• 22. augusta 1994 bol Rozkazom ministra obrany Slovenskej republiky č. 53 útvaru priznaný čestný názov "Žilinský pluk Jozefa Gabčíka"
  
  
• v máji 1995 bol do funkcie veliteľa 3. špeciálneho odriadu ustanovený podplukovník Jozef Krištofiak
  
  
• k 1. októbru 1995 bol útvar reorganizovaný a premenovaný na 5.pluk špeciálneho určenia
  
  
• 30. januára 1997 bola útvaru ako prvému v histórii Armády Slovenskej republiky, rozkazom prezidenta Slovenskej republiky, prepožičaná bojová zástava
  
  
• vo februári 2001 bol do funkcie veliteľa 5. pluku špeciálneho určenia ustanovený podplukovník Ľubomír Šebo
  
  
• od 1. októbra 2001 bol 5. pluk špeciálneho určenia reorganizovaný a profesionalizovaný na 85 %
  
  
• od roku 2002 je pluk plne profesionalizovaný
  
  
• v súčasnosti je pluk zaradený do podriadenosti Generálneho štábu ozbrojených síl Slovenskej republiky 

• od 1. marca 2017 bol do funkcie veliteľa 5. pluku špeciálneho určenia ustanovený plukovník Miroslav Gardlo

• od 1. augusta 2019 bol do funkcie veliteľa 5. pluku špeciálneho určenia ustanovený plukovník Pavol Šebík

• od 1. októbra 2019 bol 5. pluk špeciálneho určenia podriadený Veliteľstvu Síl pre špeciálne operácie OS SR